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圣湘速度!DeepSeek基因測序全面應用方案

2025-02-12 23:27

2月12日,圣湘生物數智測序系統正式接入DeepSeek,全面應用于病原測序解決方案,引領AI醫療加速落地。呼吸道、測序兩大戰略系統接續接入DeepSeek,充分展示了圣湘速度和全面擁抱AI的信心。


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今年1月,圣湘生物SansureSeq 1000 高通量測序儀成功獲得國家藥品監督管理局頒發的三類醫療器械注冊證。該儀器采用先進的可逆末端終止測序法,技術路線與國際主流測序儀高度兼容,能夠為臨床診斷和科研應用提供精準、高效的數據支持;高通量、高準確性的特點,使其在腫瘤檢測、遺傳病篩查、病原體檢測等多個領域展現出巨大的應用潛力。基于該儀器,圣湘生物研發推出感染性疾病綜合解決方案、遺傳性疾病全基因組測序解決方案、生殖健康解決方案等多種方案,并已在眾多疾病預防控制中心及醫院得到應用。


此次,圣湘生物數智測序系統正式接入DeepSeek后,將全面應用到mNGS、tNGS、細菌/病毒基因組、多組學等產品方案中,結合增強索引(RAG)技術,整合圣湘生物病原專屬知識庫,輔助醫生進行診斷。患者臨床信息結合圣湘海量病原微生物基因測序數據進行模型訓練,協助醫生回溯病情完整發展歷程,精準、自動抓取相應指標參數,對大量臨床信息梳理呈現并進行病原感染分析推理,輔助病原陽性判斷,形成自動化報告。同時面對棘手的罕見病原體,檢驗醫生可拋出疑問,隨即收獲海量前沿病原知識,提前預警重癥危急值,為患者救治爭取寶貴的時間,筑牢智慧根基。

圣湘生物數智測序系統操作演示


借助DeepSeek卓越語言理解能力、強大信息檢索能力和推理能力,圣湘生物已著手將其應用到mNGS和tNGS的研發中。一是構建并維護知識庫數據庫,對感染病原體生物學、醫學特征、耐藥、毒力及用藥指導等關鍵信息進行高效快速提取,并定期更新知識庫,確保數據時效性和準確性。二是打造報告解讀智能體,即結合多模態數據(基因檢測、影像學、生化指標等),快速解讀測序報告,提供臨床意義解讀和治療建議。


同時,利用DeepSeek,圣湘生物也將著手解決mNGS測序、tNGS測序、遺傳病輔助診斷系統、多組學分析系統等痛點難點問題。如數據庫龐大且更新麻煩、清洗和篩選方法復雜;部分近緣病原體識別困難,對報陽病原體的致病性難以進行評估;報告解讀自動化程度不高,影響整體檢測效率;panel設計流程復雜、周期長;分析系統對于突變的致病性評估準確性不夠,需花費大量人工復核;多組學數據整合分析困難,早篩biomarker難以確定等。


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近年來,圣湘生物在隱私計算技術方向上進行了積極探索和布局,通過同態加密等技術保障基因數據的"可用不可見"。2024年iDASH國際隱私計算競賽上,公司斬獲同態加密賽道全球第一名。目前圣湘生物已將隱私計算及人工智能等先進技術廣泛應用于多個平臺,并在傳染病數智化系統、測序全景檢測、遺傳病檢測以及慢病檢測等領域進行了深度布局。


未來,圣湘生物將基于成熟檢測技術、多平臺檢測結果以及診療數據,通過人工智能算法持續優化預測準確性和效率,簡化模型復雜度,增強模型可用性,提供涵蓋風險預警、智能化報告輸出、疾病預測等全場景的應用方案。同時,公司也將利用隱私計算技術對模型和數據流進行同步加密,確保各方數據在傳輸和運算中的隱私安全與保護。


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