1）為了保證檢測質量，臨床PCR實驗室應有充分合理的空間，良好的照明和空調設備。工作環境雖不是檢測質量的直接原因，但寬敞舒適的實驗室環境將肯定有利于檢驗質量的保證。

2）合理有效地對儀器設備進行管理，定期做維護和校準，使其處于一個良好的狀態。例如，定期校準移液器，使其保持足夠的準確度和精密度。定期維護熒光定量PCR儀的光學系統和反應孔間溫度差異，使其保持在良好狀態和允許的范圍內。此外，還包括天平，離心機，冰箱等設備的管理。

3）理想的試劑：主要有內外兩個因素，內在因素包括標本處理方法，用于核酸擴增的原材料及方法學設計等。外出因素包括試劑盒的運輸和保存中的問題。

4）標準化操作流程：完整的臨床PCR程序由標本采集，運送，保存，編號，試劑準備，核酸提取，擴增和產物檢測，結果分析和報告等諸多環節，建立科學和與本實驗室配套的SOP文件，嚴格按SOP進行操作。

5）主要污染源和防污染措施：PCR的主要污染源有標本中的大量待測微生物，克隆質粒，大量存在實驗室中的特定微生物以及以前擴增產物的殘留污染等。這些都是實驗室最容易造成假陽性的污染。因此，必須嚴格分區實驗室及遵守工作流程，使用化學清潔實驗臺面，使用紫外線照射和UNG方法消除擴增產物污染等等。

6）進行室內和室間質量控制，室內質量控制可以確保實驗室室內測定質量的一致性，室間質量控制可以提供將實驗室測定情況與一室間和客觀標準進行回顧性比較的數據。